Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX9Q9Y5X1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX9Q9Y5X1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms