Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms