Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP3Q9Y2W1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms