Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG6Q9Y2V7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG6Q9Y2V7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms