Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NINLQ9Y2I6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINLQ9Y2I6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms