Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms