Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLEC11AQ9Y240 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC11AQ9Y240 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms