Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOD1Q9Y239 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms