Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms