Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms