Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms