Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms