Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms