Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms