Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00527Q9UJ94 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms