Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms