Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFMBT1Q9UHJ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms