Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms