Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEPT3Q9UH03 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEPT3Q9UH03 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms