Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCF2Q9UG63 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms