Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms