Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH10Q9P2E7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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