Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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