Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMOD2Q9NZR1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms