Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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