Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms