Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MIS18AQ9NYP9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms