Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZDHHC3Q9NYG2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms