Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM53CQ9NYF3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms