Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TOR4AQ9NXH8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms