Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCIQ9NVI1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms