Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L1Q9NU39 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms