Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDS5BQ9NTI5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms