Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms