Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT82Q9NSB4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms