Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms