Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms