Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX15Q9NRS6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms