Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms