Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms