Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms