Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTA1Q9NP79 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms