Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms