Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms