Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNPKQ9C0E8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNPKQ9C0E8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms