Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHACTR1Q9C0D0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHACTR1Q9C0D0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms