Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms