Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms