Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms