Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDHR2Q9BYE9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDHR2Q9BYE9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDHR2Q9BYE9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms